Abstrato

Rastreio genómico de módulos relacionados com a parede celular em Mycobacterium tuberculosis com base na análise de coexpressão em larga escala

Huaidong Wang, Bingqiang Liu, Zhuoyuan Xin, Zipeng Duan, Xiaoyu Sun, Yan Lin, Zhifeng Yang, Guoqing Wang*, Fan Li*

A parede celular do Mycobacterium tuberculosis desempenha um papel importante na patogénese. É impossível analisar os genes associados à parede celular um a um, pois falta a anotação funcional. Aqui, realizámos análise de agrupamento de dados de expressão de microarranjos de genes e adquirimos 33 módulos de coexpressão através da construção de redes co-reguladas de três nós. Um total de 555 genes relacionados com a parede celular foram previstos nos módulos utilizando um modelo de regressão logística multifatorial e análise de previsão de motivos. A análise do módulo identificou 15 genes sem anotação que também estavam associados à parede celular. Vinte e cinco módulos continham motivos significativos e os genes de 10 destes 25 módulos partilhavam um motivo comum. A abordagem metodológica aqui utilizada pode ser aplicada à identificação e descrição de outros genes associados à função no genoma do M. tuberculosis. Os resultados deste estudo podem melhorar a compreensão da parede celular do M. tuberculosis e encontrar novos alvos para os fármacos anti-TB.