Abstrato

Um modelo prognóstico para o carcinoma hepatocelular baseado em RNA longo não codificante conhecido relacionado com a ferroptose

Congyue Zhang1,2, Chaoqun Zhang1,2, Huifang Zhou2, Zhankai Hu1, Dianxing Sun2*

Fundamento: O carcinoma hepatocelular (CHC) é uma doença maligna prevalente em todo o mundo, e a ferroptose é um processo de morte celular dependente de ferro. Além disso, a expressão aberrante de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) que contribuem para o desenvolvimento e progressão do CHC tem despertado maior interesse.

Materiais e métodos: Recolhemos perfis de expressão de lncRNA associados à ferroptose e informação clínico-patológica das bases de dados The Cancer Genome Atlas (TCGA) e FerrDb. A relação entre os lncRNAs relacionados com a ferroptose (FRlncRNAs) e a sobrevivência dos doentes com CHC é determinada pela análise de coexpressão da Sobrevivência Global (OS). Utilizando a análise de regressão de Cox e o algoritmo LASSO, foi desenvolvido um modelo prognóstico de lncRNA de 22 lncRNAs diferencialmente expressos.

Resultados: O perfil de lncRNA de alto risco foi associado a um mau prognóstico no CHC, determinado por uma análise de Kaplan-Meier. Na previsão do prognóstico do CHC, o nosso modelo de avaliação de risco superou os dados clínicos convencionais. A GSEA descobriu vias imunológicas e relacionadas com tumores em indivíduos de alto e baixo risco. Além disso, o TCGA revelou que as funções das células T, como as células B, macrófagos citolíticos, MHC de classe I, mastócitos, neutrófilos, células NK, células T auxiliares, IFN Tipo I e IFN Tipo II, diferiam significativamente entre os grupos de alto risco e grupos de baixo risco. Os pontos de controlo imunológico também foram expressos diferencialmente entre os grupos de risco, incluindo TNFSF18, IDO2, CD276, NRP1 e TNFSF4.

Conclusão: Com base nos lncRNAs associados à ferroptose, os nossos achados fornecem um modelo robusto de previsão do prognóstico e da resposta imunitária para doentes com CHC.