Abstrato

Previsão Computacional, Identificação de Alvos e Validação Experimental de miRNAs de Etiquetas de Sequência Expressa em Cannabis sativa. eu

Ganesh Selvaraj Duraisamy, Ajay Kumar Mishra, Jernej Jakse e Jaroslav Matousek

Os microRNAs (miRNAs) são RNAs não codificantes de aproximadamente 20-22 nucleótidos, que desempenham um papel importante na degradação pós-transcricional do mRNA alvo ou na inibição da síntese proteica através da ligação aos locais específicos do mRNA alvo. Os miRNAs têm sido extensivamente estudados em várias espécies de plantas, no entanto, não há nenhum miRNA identificado na Cannabis sativa, uma cultura que tem sido usada há muito tempo para produção de fibra de cânhamo, para sementes e óleos de sementes, para fins medicinais e como droga recreativa. Neste estudo foi utilizada uma abordagem de base computacional para identificar e caracterizar os miRNAs de C. sativa. Um total de 7 miRNAs pertencentes a 3 famílias de miRNAs foram identificados na canábis com base na pesquisa de homólogos e numa série de critérios de filtragem. Os miRNAs identificados foram validados por PCR endpoint e reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa quantitativa (qRT-PCR), confirmando a existência de miRNAs conservados em C. sativa. Com base na complementaridade quase perfeita entre os miRNAs de canábis e a sua sequência genética alvo de mRNA, foram identificados um total de 23 alvos de miRNAs envolvidos em processos como o desenvolvimento de plantas, transdução de sinal, produção de metabolitos secundários, degradação de proteínas, resposta ao stress ambiental e à invasão de patogénicos, e capacidade de regular a sua própria biogénese. Os elementos cisreguladores relevantes para o stress biótico e abiótico, a resposta hormonal vegetal à biossíntese de flavonóides e canabinóides foram identificados nas regiões promotoras destes genes de miRNA. No geral, as descobertas deste estudo irão acelerar o caminho para futuras pesquisas sobre miRNAs e as suas funções em C. sativa, particularmente na via metabólica dos canabinoides.

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