Abstrato

Caracterização do genoma completo do cloroplasto de Rhus Chinensis (Anacardiaceae), uma importante planta medicinal e económica da China

Zhumei Ren, Ting Lv, Xu Su e Jun Wen

Rhus chinensis é uma árvore caducifólia comum na zona temperada quente do leste da Ásia, onde vivem os pulgões sumagre chineses para formar nozes com taninos ricos. Aqui, montámos o genoma completo do cloroplasto de R. chinensis com o método de skimming do genoma shot-gun numa plataforma Illumina HiSeq4000. O genoma completo do cloroplasto de R. chinensis tinha 149.083 pb de comprimento e uma estrutura quadripartida padrão com regiões de cópia única grandes (LSC, 97.271 pb) e pequenas (SSC, 18.524 pb) separadas por um par de repetições invertidas (IRs, 16.644 bp cada). Anotámos com sucesso 126 genes, incluindo 82 genes codificadores de proteínas, 36 genes de tRNAs e oito genes de rRNAs. Entre estes genes, 29 genes localizados em regiões IR. O conteúdo global de GC do genoma completo do cloroplasto atinge os 45,5%.