Abstrato

Caracterização de DsrK e DsrO de Allochromatium vinosum e outras Proteobactérias usando sequências de aminoácidos

Semanti Ghosh e Angshuman Bagchi

O metabolismo do enxofre é um dos mais antigos ciclos geoquímicos redox conhecidos em nosso ambiente. Um dos operons envolvidos neste processo é chamado de operon dsr. O operon está envolvido no equilíbrio e utilização de compostos de enxofre ambientais. Um dos principais participantes deste operon é o complexo DsrMKJOP. DsrO é uma proteína periplásmica e liga aglomerados de FeS, que é principalmente responsável pela transferência de elétrons para DsrP. DsrP pode estar envolvido na transferência de elétrons de DsrP para DsrM. DsrM então doaria elétrons para DsrK, a subunidade catalítica deste complexo. No presente estudo, tentamos analisar os prováveis ??detalhes moleculares das proteínas DsrO e DsrK de um conjunto diverso de espécies microbianas usando apenas suas informações de sequência. Existem certas mutações presentes no domínio conservado da proteína. Essas mutações conferem alguma funcionalidade adicional à proteína. Sequências das proteínas DsrO e DsrK de diferentes espécies proteobacterianas foram analisadas para estudar os efeitos de mutações nas sequências e uma relação filogenética entre os organismos foi desenhada. Analisamos também os padrões estruturais secundários das proteínas DsrK e DsrO. Não há relatórios anteriores que lidem com a análise bioinformática das proteínas DsrO e DsrK. Este é até agora o primeiro relatório desse tipo. Nosso estudo, portanto, abriria caminho para futuros estudos genéticos e mutacionais usando proteínas DsrK e DsrO que levariam à iluminação do mecanismo bioquímico do metabolismo do enxofre.