Yan Che, Jing Ding, Yan Zhang
Contexto: Considera-se que os fatores genéticos determinam o equilíbrio dos processos de coagulação e anticoagulação, mas as variantes genéticas relacionadas com o Tromboembolismo Venoso (TEV) permanecem obscuras. Este estudo teve como objetivo investigar os potenciais mecanismos moleculares e mutações patogénicas associadas ao TEV, determinando genes diferencialmente expressos (DEGs) relacionados com o TEV através do perfil de todo o transcriptoma e avaliando a estrutura proteica no TEV.
Métodos: Dois conjuntos de dados de expressão genética, GSE48000 e GSE19151, foram acedidos a partir da base de dados Gene Expression Omnibus (GEO) para obter dados de expressão genética associados ao TEV. Identificámos os DEGs entre doentes com TEV e pessoas saudáveis ??utilizando R e realizámos análise de enriquecimento funcional, incluindo análise de Gene Ontology (GO) e Enciclopédia de Genes e Genomas de Quioto (KEGG). De seguida, foi realizada a sequenciação completa do exoma (WES) para 25 doentes com TEV e 17 casos normais, e as localizações estruturais das mutações patogénicas missense foram identificadas utilizando o pyMOL. Por fim, foi utilizada a base de dados DGIdb para selecionar os medicamentos candidatos ao tratamento do TEV.
Resultados: Um total de 232 DEGs foram identificados na base de dados GEO. A função significativa destes DEGs estava principalmente envolvida no processo catabólico do RNA e na via do ribossoma. Notavelmente, os resultados do WES para os DEGs e a análise da estrutura proteica mostraram que a histamina N-metiltransferase ( HNMT ) (chr2: 138759649 C>T, rs11558538) pode ser o principal fator predisponente para o TEV. Além disso, a amodiaquina, harmalina, aspirina, metoprina, dabigatrana e difenidramina foram avaliadas para terapia de TEV.
Conclusão: Os resultados mostraram que o HNMT (chr2: 138759649 C>T, rs11558538) pode ser um potencial alvo para o diagnóstico e tratamento do TEV.
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