Abstrato

Análise comparativa do genoma do cloroplasto de Suaeda aralocaspica com outros genomas de Amaranthaceae

Caburatan L , Parque J *

Os cloroplastos são organitos semiautónomos necessários para o sistema de produção de alimentos das plantas. Os genomas dos cloroplastos são atualmente amplamente estudados para análises comparativas que podem ajudar a elucidar as diferenças entre espécies da mesma família de plantas. Suaeda aralocaspica é uma espécie de planta C4 unicelular pertencente à família Amaranthaceae na subfamília Suaedoideae. No entanto, nem todas as espécies de plantas de Suaedoideae utilizam a fotossíntese C4, uma vez que a maioria das suas espécies de plantas utiliza a fotossíntese C3. Este estudo tem, assim, como objectivo avaliar o genoma do cloroplasto de S. aralocaspica e realizar uma análise comparativa com outras quatro espécies de Amaranthaceae. O genoma do cloroplasto de S. aralocaspica foi obtido por isolamento de cloroplastos e sequenciação de ADN, bem como por montagem e anotação do genoma. A comparação do genoma foi conduzida por análise de sequências de genes, bem como pela determinação de repetições em tandem. S. aralocaspica tem 151.225 pb de comprimento com um tamanho de codificação de 77.517 pb. Possui um total de 140 genes, 86 dos quais são codificadores de proteínas. Existem 20 genes duplicados em IRa e IRb e existem 16 genes contendo intrões. Os resultados da identidade de sequência de corte de 70% mostraram que S. aralocaspica variou com outras espécies mais aparentemente no arranjo de poucos genes, como matK, atpF, rpoC2, rpoC1, ycf6, psbM, clpP, petB, rpl16, ndhA e ycf1 . Foram encontradas um total de 66 repetições em tandem em todas as espécies estudadas, a maioria delas situadas no espaço intergénico. A análise comparativa do genoma do cloroplasto mostrou que S. aralocaspica está muito mais próximo de Suaeda glauca e um pouco em variação com Suaeda acuminata e o grupo externo, Salsola tragus.