Abstrato

Um estudo comparativo sobre a proteína de ligação ao retinol em dois peixes de água doce, Danio rerio e Cyprinus carpio

Chittaranjan Baruah, Papari Devi e DK Sharma

As proteínas de ligação ao retinol (RBP) são uma família de proteínas com diversas funções. São proteínas transportadoras que se ligam ao retinol. Foi realizado um estudo in silico para previsão da estrutura 3D e análise filogenética molecular de RBP de dois peixes de água doce, Danio rerio e Cyprinus carpio . As análises foram realizadas utilizando os dados de sequência do gene rbp e da proteína de ligação ao retinol, extraídos das bases de dados Gen Bank e UNIPROKB/SWISSPROT, respetivamente. As análises evolutivas do gene rbp foram conduzidas em MEGA5 pelos métodos de Máxima Verosimilhança e Máxima Parcimónia. O presente estudo representa a aplicação de modelação comparativa para a previsão da estrutura 3D de RBP e análises filogenéticas moleculares do gene rbp em MEGA5, utilizando dois métodos diferentes, nomeadamente a Máxima Parcimónia e a Máxima Verosimilhança. As estruturas previstas foram depositadas na Protein Model Database (PMDB) após verificação estatística. O estudo mostra que o gene rbp de Cyprinus carpio é o ortólogo mais próximo do gene rbp de Denio rerio. As estruturas da RBP podem ser úteis na biologia estrutural para investigações adicionais sobre os sítios ativos, o mecanismo molecular da função e a filogenia baseada na estrutura. A estrutura será útil na compreensão adicional da interação do complexo RBP-retinol com a transtirretina em peixes de água doce. A árvore filogenética revelou a relação evolutiva da família RBP.